Den största delen av EU:s budget, ungefär 45 procent, går till jordbruksstöd, landsbygdsutveckling och miljöåtgärder. Satsningar på hållbar tillväxt utgör cirka 40 procent av budgeten. Det innefattar främst EU:s regionalpolitik, men innehåller också satsningar på till exempel forskning, utbildning och transporter. Utrikespolitiska åtgärder står för drygt 7 procent av utgifterna. Ungefär 1 procent läggs på utgifter för brottsbekämpning och polissamarbete. De administrativa utgifterna utgör ungefär 6,6 procent av budgeten.
EU har ingen egen rätt att ta ut skatt och budgeten finansieras därför genom medlemsavgifter från EU-länderna. Medlemsavgifterna består av:
EU:s budget fastställs av Europaparlamentet och ministerrådet. Ministerrådet har sista ordet när det gäller några av utgifterna, till exempel för jordbruksstöd och utgifter kopplade till avtal med länder utanför EU, medan Europaparlamentet har sista ordet på övriga. Det är också Europaparlamentet som till sist godkänner EU-budgeten i sin helhet.
Taket för EU:s utgifter och inkomster fastställs genom en långtidsbudget. Den nuvarande långtidsbudgeten gäller för 2007-2013.