MK är en parlamentarisk demokrati. Val till parlament och kommuner hålls vart fjärde år, medan presidenten väljs för fem år i taget. Parlamentet består av 120 platser fördelade mellan 17 partier. De politiska partierna ar etniskt homogena och scenen domineras av etniska makedonier och albaner.Den 5 juli 2006 hölls ordinarie val till parlamentet. Valkampanjen präglades av upprepade våldsamheter, främst mellan anhängare till de två största albanska partierna, men sedan företrädare för bland annat EU och USA hotat med att makedonskt medlemskap i NATO och EU stod på spel kunde valet genomföras utan allvarligare incidenter. Det albanska regeringspartiet DPA lämnade koalitionen i mars 2008 på grund av missnöje med situationen för landets minoritet, men framför allt uttryckte partiet missnöje med att regeringen inte hade erkänt den serbiska provinsen Kosovos självständighet.Förtida parlamentsval genomfördes i juni 2008. Segrare blev återigen det liberalkonservativa partiet. Koalitionen "För ett bättre Makedonien", ledd av premiärminister Gruevskis parti VMRO-DPMNE, fick nästan 49 procent av rösterna medan socialdemokraternas "Koalition för Europa" vann 23,6 procent. De albanska partierna DUI och DPA fick nästan 13 respektive drygt 8 procent av rösterna. I mars 2009 hålls lokal- och presidentval.