Tyngdpunkten i Filippinernas utrikespolitik utgörs av de nära politiska, ekonomiska och kulturella förbindelserna med den tidigare kolonialmakten USA. Tyngdpunkten i Filippinernas utrikespolitik utgörs av de nära politiska, ekonomiska och kulturella förbindelserna med den tidigare kolonialmakten USA. 3 miljoner filippiner lever i USA, som också utgör ett hett eftertraktat mål för den dryga miljon filippiner som årligen lämnar sitt land i syfte att söka en bättre framtid utomlands. Filippinernas styrande ekonomiska/politiska elit har, med få undantag, fått sin högre utbildning i USA. USA står även för en betydande del av de utländska investeringarna i Filippinerna. Dessutom är dess marknad en av de viktigaste för filippinska produkter. Även om USA 1992 tvingades lämna sina militärbaser på Filippinerna utgör den amerikansk-filippinska biståndspakten från 1952 en viktig garant för landets säkerhet.
Det är främst mot denna bakgrund man får se Arroyos snabba och fullständiga uppslutning kring USA: s pådrivande roll i kampen mot den internationella terrorismen. Genom närmandet till USA har Arroyo hoppats vinna amerikanskt ekonomiskt och politiskt stöd i sin ambition att modernisera Filippinerna, bekämpa inhemsk terrorism samt på sikt, förbättra Filippinernas utsatta, säkerhetspolitiska läge i Sydkinesiska sjön. USA har gått den filippinska regeringen till mötes genom ökat militärt och ekonomiskt bistånd och har bl.a. bistått det filippinska försvaret med amerikanska militära rådgivare i jakten på den beryktade terroriströrelsen Abu Sayyaf. Gemensamma militärövningar förekommer återkommande och orsakar varje gång kritik från oppositionen om det "obalanserade" förhållandet till USA:
Trogen Filippinernas ställning som en av ASEAN: s grundnationer söker Arroyo spela en pådrivande roll i olika försök att intensifiera det ekonomiska, politiska och handelspolitiska samarbetet i regionen. Man fäster stor vikt vid samarbetet inom ASEAN och genom de vänskapsavtal som skrivs med övriga länder i regionen, inklusive Kina och Indien, Japan och Republiken Korea. Sommaren 2006 tar Filippinerna över ordförandeskapet i ASEAN för en period om ett år. Inom ASEAN-regionen har president Arroyo också försökt väcka liv i den subregionala organisationen BIMP-EAGA som arbetar för ekonomiskt hållbar utveckling i Mindanao-Brunei-Malaysia/Sabah och Indonesien. Bland länderna i Sydostasien tillmäts Kina och Japan den största betydelsen och det var en markering att hennes första utlandsresa som president gick till Kina. Ett separat bekymmer är den territoriella dispyten kring Spratley-öarna i Sydkinesiska sjön, som förutom Filippinerna och Kina även involverar Vietnam, Brunei och Malaysia. Filippinerna har spelat en pådrivande roll i de överläggningar som lett fram till deklaration från berörda länder, som fryser status quo och föreskriver att territoriella tvister skall lösas förhandlingsvägen.
Av särskild betydelse för Filippinerna är också förbindelserna till Japan i dess roll som landets näst betydelsefulla handelspartner efter USA och viktigaste enskilda biståndsgivare. Efterhand som minnena falnar från den japanska militärens framfart under ockupationstiden och den förödelse som drabbade landet under andra världskrigets slutskede har Japan utvecklats till att bli en nära partner även på det politiska området men kanske framförallt som partner i utvecklingssamarbetet.
Som ett led i kampen mot den internationella terrorismen har Filippinerna ingått avtal om ett nära underrättelse- och gränsövervakningssamarbete med grannländer som Malaysia och Indonesien. Det är ett samarbete som efter terroristdåden på Bali fått ökad aktualitet och betydelse. Filippinerna utsågs också vid APEC-mötet i Chile 2004 till ordförande i den task force mot internationell terrorism som tillskapades. Man har också tillsatt en särskilt Counter-terrorism ambassadör, den förre generalen Benjamin Defensor. Förbindelserna med den muslimska världen är betydelsefulla, dels p.g.a. den muslimska samarbetsorganisationens (Organization of Islamic Conference) roll som betydande sponsor av den av Arroyo återupptagna fredsprocessen med den muslimska separatistorganisationen MILF, dels p.g.a. närvaron av drygt 1,5 milj. filippinska gästarbetare i Mellersta östern. Malaysias medlarroll i fredsprocessen med MILF betonar också vikten i relationerna. Under sommaren 2003 undertecknades ett eldupphöravtal mellan den filippinska regeringen och MILF:s företrädare. Ett internationellt övervakningsteam för eldupphöravtalet är på plats under malaysisk ledning sedan hösten 2004. Under 2005 har fredsförhandlingarna intensifierats och framsteg har rapporterats bl.a. är frågan om landrättigheter/ancestral domain, som varit ett av de stora hindren i förhandlingarna, på väg att lösas. Det är dock svårt att sia om när ett ev. fredsavtal kan undertecknas.
Europeiska Unionen är kollektivt en viktig handelspartner och biståndsgivare till Filippinerna. Inom ramen för det institutionella samarbetet mellan EU och Asien (ASEM) utgör Filippinerna en intressant partner genom sitt engagemang för MR-frågor och sin till viss del pådrivande roll för ett fördjupat regionalt samarbete. Inom detta samarbete har Sverige tillsammans med Filippinerna och Thailand haft ett särskilt ansvar för de viktiga frågorna rörande människohandel. Ett nytt sådant samarbete har etableras rörande HIV-AIDS området.