Över hälften av Paraguays handel bedrivs med övriga medlemmar i Mercosur. En regional utvecklingsfond skapades 2005 som särskilt skulle gynna Paraguay. Brasilien och Argentina har ofta framfört oro över den stora illegala handeln som anses utgå från eller passera genom Paraguay. Cirka hälften av all paraguayansk import tros återexporteras illegalt till Argentina och Brasilien.
Paraguays (redovisade) export 2010 uppgick till 8 miljarder USD, varav den största andelen utgjordes av sojabönor och kött. Importen uppgick till 9,6 miljarder USD och bestod framför allt av konsumtionsvaror, bränsle och kapitalvaror.
Handeln mellan Sverige och Paraguay är begränsad. Svensk export till Paraguay uppgick under 2010 till 108,9 miljoner SEK, en siffra som innebär en 42-procentig ökning från året dessförinnan Exporten bestod främst av traditionella svenska verkstadsprodukter följt av matvaror och halvfabrikat.
Sveriges import från Paraguay uppgick år 2010 till 720 000 SEK, vilket innebär en minskning på 73 procent från förra året. De produkter som representerar den procentuellt sett största minskningen är matvaror samt verkstadsprodukter.
Det finns ett uttalat intresse från Paraguays sida för att öka handelsutbytet med Sverige och man har bl a uttryckt intresse för olika svenska miljölösningar, som t ex biogasbussar. Ett liknande intresse har uttryckts för samarbete inom skogsnäringen där landet har en målsättning att stärka det hållbara skogsbruket.