Sveriges ambassadör i Rumänien är sidoackrediterad i Moldavien. I Chisinau finns ett svenskt honorärkonsulat och ett Sida-kontor.
Sverige antog i mars 2007 en ny fyraårig utvecklings- och samarbetsstrategi för Moldavien. Denna syftar till att stödja landet med omkring 100 miljoner kronor per år för reformer inför ökad europeisk integration. År 2006 var Sveriges export till Moldavien 66 m SEK medan importen låg på 39 m SEK.
Svenska Institutet arrangerar ett utbytesprogram för moldaviska lärare och studenter. Institutet har tidigare finansierat en utsänd lektorstjänst i svenska språket vid universitetet i Chisinau. Denna undervisning sker nu av en moldavisk lärare.
Besöksutbytet har ökat mellan Sverige och Moldavien. I juni 2006 invigde utrikesminister Andrei Stratan Moldaviens nyöppnade ambassad i Stockholm. Biståndsminister Gunilla Carlsson besökte Moldavien i mars 2007 för att presentera Sidas strategi. Moldaviens president Vladimir Voronin besökte Sverige i april 2007. I september besökte den svenska barnombudsmannen, Lena Nyberg, Moldavien.
Det faktum att Karl XII vistades i staden Bender, som ligger på gränsen till nuvarande Transnistrien, mellan 1709 och 1715 kommer eventuellt att uppmärksammas vid ett trehundraårsjubileum år 2009.