Parlamentsval hölls i Moldavien 1994 varvid kommunistiska partiet (PCRM) förlorade sin majoritet i parlamentet. En ny konstitution antogs. PCRM röstades dock med klar majoritet tillbaka till makten 2001 genom ett program om närmande till Ryssland jämte ansträngningar för en moldavisk anslutning till unionen mellan Ryssland och Vitryssland. Vladimir Voronin utsågs av parlamentet till president. Moldavien är därmed den enda tidigare sovjetrepublik som på demokratisk väg röstat ett kommunistiskt parti tillbaka till makten. President Voronin och PCRM har under den senaste tiden ändrat landets politiska kurs och verkar nu för ett närmande till EU. Goda handelsrelationer med Ryssland förblir dock av betydelse för Moldaviens ekonomi.
PCRM är efter parlamentsvalet våren 2005 alltjämt i majoritetsställning i parlamentet. President Voronin omvaldes med stöd av PPCD och DP. Oppositionen är svag och splittrad. Visst resultat har uppnåtts inom vissa frågor som EU-närmandet och Transnistrien-frågan (återinlemmande i Moldavien, fast med viss autonomi). Den makroekonomiska stabiliteten har uppnåtts genom ett omfattande bistånd från världsbanksgruppen, EU samt bilaterala givare. Vid det kommande parlamentsvalet 2009 återstår det att se om oppositionspartierna kan enas och på så sätt erbjuda de moldaviska väljarna ett annat alternativ än PCRM.
I juni 2007 hölls lokalval. Borgmästarposten i Chisinau vanns av en mycket ung liberal kandidat. Det har emellertid tagit lång tid att få fram en fungerade stadsstyrelse. Efter valet håller kommunistpartiet fortfarande ställningarna på många ställen i landet men är föremål för växande kritik.