Syrien och EU kom i oktober 2004 i princip överens om ett associationsavtal. Avtalet, som ännu inte undertecknats, omfattar bland annat handel och politisk dialog, inklusive mänskliga rättigheter. De delar av avtalet som faller under EU-kommissionens kompetens – främst de handelsrelaterade aspekterna - träder i kraft efter att EU:s medlemsstater godkänt det och det undertecknats av EU-kommissionen och Syriens president. Därefter ska avtalet ratificeras av Syrien och samtliga EU:s medlemstater innan övriga delar av avtalet träder ikraft.
EU bedriver utvecklingssamarbete med Syrien genom det europeiska grannskaps- och partnerskapsinstrumentet (European Neighbourhood and Partnership Instrument - ENPI). Ett landstrategidokument (Country Strategy Paper - CSP) som antogs i mars 2007 drar upp riktlinjerna för utvecklingssamarbetet med Syrien under perioden 2007-13. Dokumentets innehåll utvecklas i större detalj i ett nationellt programdokument (National Indicative Programme - NIP) med en budget om 130 miljoner euro för perioden 2007-10. Syrien omfattas också av European Initiative for Democracy and Human Rights (EIDHR). European Investment Bank (EIB) beviljar lån till Syrien.EU är Syriens största handelspartner, även om handeln minskat under de senaste åren. Ungefär hälften av Syriens totala export går till EU-länder. Ungefär 85 procent består av oljeprodukter. Cirka 30 procent av Syriens totala import kommer från EU.