Ordförandeskapsprogrammet omfattar fyra områden:
En fungerande gemenskap
Mot bakgrund av att Frankrike och Nederländerna röstat nej till förslaget om konstitutionellt fördrag gav Europeiska rådet i juni 2006 det tyska ordförandeskapet i uppdrag att upprätta en rapport. Rapporten ska undersöka möjliga framtida utvecklingslinjer och utgöra en grund för beslut om hur EU:s reformprocess ska fortsätta.
Ekonomiska, sociala och miljöfrågor
Det tyska ordförandeskapet konstaterar att Europa måste resursmobilisera, systematiskt verka för tillväxt och sysselsättning, samt främja ett "kunskapens Europa" genom ökade investeringar i forskning och utbildning. Ordförandeskapets prioriteringar inom området grupperas under följande rubriker:
Frihet, säkerhet och rättvisa
Ordförandeskapsprogrammet understryker att EU:s medborgare förväntar sig att EU agerar för att bevara deras frihet och säkerhet, i synnerhet inom ramen för kampen mot terrorism och organiserad brottslighet. Programmet betonar även andra utmaningar, som illegal invandring, att motverka antisemitism och främlingsfientlighet, samt att integrera invandrare. Det konstaterar också att ett gemensamt civil- och straffrättsligt område är nödvändigt för att fullborda den inre marknaden. Följande områden anges som prioriterade:
Yttre förbindelser
Rubriken samlar de politikområden där EU agerar utanför unionens gränser, utvidgningen, den gemensamma utrikes- och säkerhetspolitiken, extern ekonomisk politik, samt biståndspolitik. Det tyska ordförandeskapet vill verka för en mer effektiv och samstämmig utrikespolitik. Inom detta område fokuserar man på ett fåtal rubriker: