Läs mer på sektionskontoret i Honuras hemsida
2001 var det svenska biståndet extraordinärt högt med 324 MSEK, då ca 150 MSEK användes till att återuppbygga infrastruktur som förstörts av orkanen Mitch. Stödet under 2002 uppgick till 100 MSEK, under 2003 till 101 MSEK och under 2004 till 200 MSEK. Det svenska stödet och samarbetet med Honduras koordineras av Sida. Samarbetet går framför allt ut på att befrämja ett demokratiskt styrelseskick, respekt för mänskliga rättigheter samt social och ekonomisk utveckling. Målsättningarna är flera: att minska fattigdomen, de stora inkomstklyftorna samt att bekämpa korruptionen. Dessutom syftar biståndet till att öka jämställdheten mellan kvinnor och män samt till att förbättra landets hälsovård, utbildning och miljö. Det sistnämnda görs genom att befrämja en tydligare kommunikation mellan kommunerna och det civila samhället beträffande bostadsbyggande, vatten - och sanitetsfrågor, kommunutveckling och personlig säkerhet. Biståndet definieras utifrån landets fattigdomsstrategi PRS (Poverty Reduction Strategy) och riktlinjerna inom HIPC-initiativet.
Det svenska biståndet förmedlas dels direkt genom bilaterala projekt/program, genom samarbete med multilaterala organisationer såsom IDB (Inter-American Development Bank), Världsbanken, UNDP (United Nations Development Programme) och OAS (Organisation of the American States), dels genom inhemska, svenska och internationella NGO:s. I och med att Sverige upprättat en lokal ambassadsektion i Tegucigalpa (organisatoriskt tillhörande den svenska ambassaden i Guatemala) har stödets förutsättningar och Sidas samarbetsmöjligheter förbättrats.
Honduras omfattas också av tre regionala kreditlinjer som Sida via Swedfund stödjer: CABEI (Centralamerikanska Banken för Ekonomisk Integration) som förföll i maj 2005, CAIF (Central American Investment Facility) och CFA (Corporación Financiera Ambiental). I övrigt finansierade Sverige åren 1997-2003 tillsammans med Norge Exportpyme – Centroamérica, ett framgångsrikt ITC-UNCTAD-WTO-program med syfte att stärka den exportfrämjande kapaciteten i regionens länder.