Det övergripande målet för det svenska regionala samarbetet är att förbättra förutsättningarna för länderna och organisationerna på den afrikanska kontinenten att mer effektivt hantera gränsöverskridande aspekter av fattigdomsbekämpning. Stödet ska fokusera på frågor av regional relevans och som skapar ett regionalt mervärde.
REEDs verksamhet bidrar till uppfyllandet av regeringens Strategi för Regionalt Utvecklingssamarbete med Afrika inom två huvudsektorer:
Vad gäller samarbetspartners prioriterar REED stöd till regionala samarbetsorganisationer, exempelvis East African Community, för att de ska kunna genomföra det mandat de har fått från sina medlemsländer. En programansats som utgår från organisationernas egna utvecklingsplaner och strategier är att föredra, och REED strävar efter att använda principerna för biståndseffektivitet på regional nivå. Andra samarbetspartners är till exempel organisationer som arbetar med flodavrinningsområden, såsom the Nile Basin Initiative, eller organisationer som företräder det civila samhället eller den privata sektorn på regional nivå. Stöd utgår också till några strategiska regionala forskningsråd.
En ny svensk strategi för regionalt utvecklingssamarbete med Afrika beslutades av den svenska regeringen den 14 oktober 2010 och utgör grunden för REEDs framtida arbete.